Prácticamente desde el inicio del cultivo de vegetales ya se hicieron diferentes cruzamientos entre distintas plantas, se hacían principalmente para conseguir mejorar su rendimiento y acelerar su crecimiento. En 1946 se descubrió que el ADN se podía transferir entre distintos organismos. A finales del siglo XX se comenzó a trabajar directamente con los genes enganchando y cortando determinados genes para crear nuevas plantas o hacerlas más resistentes a las enfermedades.
La primera planta genéticamente modificada no fue la de un alimento sino la del tabaco en 1983. El primer alimento transgénico comercializado fue el tomate Flavr Savr que se empezó a vender en 1994 en Estados Unidos, la modificación se realizó para retrasar su maduración. Lo elaboró la empresa Calgene aunque después esta empresa fue comprada por Monsanto y solo duraron 3 años en el mercado.
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